医院洁净手术室工程的“无菌”环境主要通过空气“过滤”、“层流”和室内“正压”来维持，控制污染源，减少污染，不仅取决于设计的质量，而且取决于经营管理的水平，医院洁净手术室工程管理应强调:
(1)净化工程系统的过滤器主要控制粉尘，但人员的移动、仪器设备的移动、手术室门的开闭等都会形成新的气流。由于这些气流颗粒和棉絮会落在作业现场，我们采取了作业、轻走、减布等措施，应该严格控制进入房间的人数。
(2)进入层流手术室，必须更换洗涤衣物、裤子、鞋帽，并设置专人管理，严格执行层流手术室的准入制度。
(3)尽量减少打开手术室的次数和时间(严禁打开手术的门)，保持相对封闭的状态，以防止外来污染源的进入。
(4)参观人数少于6人。参观者不得在房间内随意走动或走动。室内用品相对固定。减少员工因进进出出造成的污染，保证室内空气的清洁，减少活动，是减少污染的有效途径。
(5)为病人进入手术室建立一个特殊通道，病房里所有的车床和床都不能进入手术室，患者转诊时，应在手术室入口处使用转诊车，将室内外分隔开。换好衣服后，病人可以进入手术室，转乘车辆应每天用消毒剂擦拭。
(6)操作后，对所有室内物品、墙面、地面进行彻底、及时的清洗，并定期对层流系统的功能状态进行检测。并对层流手术室环境空气清洁度指标和月细菌培养情况进行了测试，连续作业应在前一次作业完成后立即进行室内清洗试验，第二次作业应在30分钟后进行(100级，15分钟)。
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