无菌制造系统使用工房的装修，应体现出工房围护结构的空气密封性好，房内无卫生死角，装修材料表面光洁但不反光、耐压力而不起尘、易于清洁、不易发生霉变和长菌、能够适应各种消毒剂和气体灭菌熏蒸的腐蚀和紫外线照射。
无菌室常用的装修材料有以下几类：
一、操作室地面：
1. 刚性地面。刚性地面多为水磨石制造，其整体性好、光滑、不易起尘、易擦洗清洁，而且经久耐用；
2. 涂料地面。常采用环氧自流坪地面，表面光滑、不易起尘、耐腐蚀可擦洗，但材料的硬度较低；
3. 弹性地面。使用聚氯乙烯弹性塑料制造，地面光滑、不起尘、耐腐蚀可擦洗，但不耐紫外线长期照射，不耐冲击。
二、操作室墙面：
1. 砖墙＋涂料（乳胶漆、仿磁漆、油漆）；
2. 板材（彩钢板、其他材料板）。
三、天花板：
1. 硬质（混凝土）；
2. 软质(轻钢龙骨＋板抹灰、石膏板，彩钢板）；
四、操作室内门窗：
1. 门要能紧闭、平整、简单，原则上朝洁净级别要求高或室内方向开启，不采用木质材料；
2. 窗应无缝隙，室内与墙面平，室外窗台应向下倾斜，不积尘。传递窗两边的门应连锁，密闭性好，易于清洁。
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